इन्फ्रारेड थेरेपी मुख्य रूप से मानव शरीर के शारीरिक कार्य और रोग संबंधी स्थिति में सुधार करने के लिए अवरक्त के थर्मल प्रभाव और गैर-थर्मल प्रभाव का उपयोग करती है। विशिष्ट सिद्धांत इस प्रकार हैं: थर्मल प्रभाव सिद्धांत आणविक कंपन गर्मी उत्पादन अवरक्त माइक्रोवेव और दृश्यमान प्रकाश के बीच एक आवृत्ति के साथ एक अदृश्य प्रकाश है। मानव ऊतकों में विभिन्न अणु (जैसे प्रोटीन, न्यूक्लिक एसिड, वसा, आदि) अवरक्त किरणों के विकिरण के तहत कंपन करेंगे। क्योंकि इन अणुओं द्वारा अवरक्त फोटॉन की ऊर्जा को अवशोषित किया जा सकता है, अणुओं की गतिज ऊर्जा बढ़ जाती है, जो बदले में आणविक कंपन को तेज करने का कारण बनता है। यह कंपन गर्मी उत्पन्न करता है, जैसे हम अपने हाथों को रगड़ने पर गर्म महसूस करते हैं। उदाहरण के लिए, जब पानी के अणुओं को अवरक्त किरणों के संपर्क में लाया जाता है, तो उनके हाइड्रोजन-ऑक्सीजन बॉन्ड का कंपन आयाम बढ़ता है, और अणुओं की थर्मल गति बढ़ जाती है, जिससे स्थानीय ऊतकों का तापमान बढ़ जाता है। त्वचा और मांसपेशियों जैसे ऊतकों में पानी की सामग्री अधिक होती है, इसलिए इन्फ्रारेड किरणें इन ऊतकों को जल्दी से गर्म कर सकती हैं। त्वरित रक्त परिसंचरण जब स्थानीय ऊतकों का तापमान बढ़ता है, तो शारीरिक प्रतिक्रियाओं की एक श्रृंखला होती है। सबसे पहले, तापमान में वृद्धि से रक्त वाहिकाओं को पतला करने का कारण होगा, विशेष रूप से केशिकाएं। यह पानी के पाइप को गर्म करने और इसका विस्तार करने और गाढ़ा होने जैसा है। रक्त वाहिकाओं के पतन के बाद, रक्त के प्रवाह का प्रतिरोध कम हो जाता है और रक्त प्रवाह की गति बढ़ जाती है। उदाहरण के लिए, इन्फ्रारेड थेरेपी मांसपेशियों के तनाव की साइट पर किया जाता है। जैसे -जैसे तापमान बढ़ता है, मांसपेशियों के ऊतकों में रक्त वाहिकाओं का विस्तार होता है, और अधिक रक्त ऑक्सीजन और पोषक तत्वों को क्षतिग्रस्त मांसपेशियों की कोशिकाओं तक ले जा सकता है। इसी समय, चयापचय अपशिष्ट, जैसे कि लैक्टिक एसिड, को अधिक प्रभावी ढंग से ले जाया जा सकता है, जिससे मांसपेशियों की थकान और दर्द से राहत मिलती है। बढ़ाया चयापचय जैसा कि रक्त परिसंचरण में तेजी आती है, सेल चयापचय भी बढ़ाया जाता है। कोशिकाएं अधिक पर्याप्त ऑक्सीजन और पोषक तत्व प्राप्त कर सकती हैं, और उनकी चयापचय गतिविधियाँ अधिक सक्रिय हैं। उदाहरण के लिए, पर्याप्त ऑक्सीजन आपूर्ति के साथ, सेल में माइटोकॉन्ड्रिया एरोबिक श्वसन को अधिक कुशलता से कर सकता है और कोशिका के विभिन्न शारीरिक कार्यों के लिए अधिक ऊर्जा (एटीपी) का उत्पादन कर सकता है। एक ही समय में, चयापचय कचरे का निर्वहन भी चिकनी है, जो इंट्रासेल्युलर वातावरण की स्थिरता को बनाए रखने में मदद करता है। कुछ पुरानी भड़काऊ साइटों के लिए, बढ़ाया चयापचय सूजन के गायब होने और ऊतकों की मरम्मत को बढ़ावा दे सकता है।